Miasta i miasteczka pojezierza suwalskiego powstawały w najbardziej dogodnym miejscu, czyli nad zbiornikami wodnymi, nad rzekami. Tak jak to było ogólnie przyjęte w dawnych czasach. Na terenie Suwalszczyzny nie stanowiło to problemu, ze względu na dużą ilość rzek. Nie są to imponująco duże rzeki, raczej spokojnie płynące, z mnóstwem zakrętów. Czarna Hańcza, znana ze wspaniałych warunków do uprawiania kajakarstwa, łączy się w swoim biegu z Niemnem. Do Niemna zdążają też Marycha i Szeszupa. Z Wisłą łączą się Rospuda i Blizna. Rzeki pojezierza mają swoje odbicie w herbie Suwalszczyzny, trzy faliste, niebieskie linie oznaczają Czarną Hańczę symbolizującą Suwalszczyznę, Marychę należącą do Sejneńszczyzny i augustowską Rospudę. Na pojezierzu są dziesiątki rzek, malutkich rzeczek i strumyków, które choć liczne nie grożą powodzią, tworząc niewielkie rozlewiska na wiosnę. Większość dostępna jest dla kajakarzy, którzy tłumnie odwiedzają te tereny.